商税牵连的更广，除了各家奴仆经营的铺子，还有很多私盐、私铁等见不得光的，多是当地士族跟卫所军官相互勾结共同运作，杀父之仇，夺财之恨，不共戴天！庞大的利益团体开始反扑于是读书人纷纷罢课，到孔庙门前烧书，煽动老百姓围攻警察局，使得遍地烽火。
洪承畴得了李云崖十二字批语之后，从北直隶紧急调了三千武警南下，李云崖又给他从京营派了一万精兵，开始锁拿镇压，凡是带头闹事煽动百姓的，无论是举人还是秀才，不管过去做过什么样的大官，一律依照公安法，就地问斩，参与闹事的，革除功名，抄没家产。
如果没有李云崖，再过十几年，清军入关南下，开始扬起屠刀，血腥镇压，这些人当众除了少数有骨气的之外，大多主动剪掉辫子，向满清屠夫摇尾乞怜，这会跟大明朝耍赖皮的能力，到了那时候再也没有了。
洪承畴在一个月之内，通报中央，连斩了七十八名首犯，进士出身的就有四个，革出功名的举人三百六十八人，秀才两千有余，举国震惊。
这些读书人敢怒而不敢言，偷偷在家里立书做传，把当下的大明朝描绘成为一个史上最黑暗的时代，国家马上就会崩溃灭亡，自己是如何的忧国忧民，一身才华却无处施展……并指出，一切罪恶的根源都是国师李云崖，号召天下所有的侠士们，一起站起来斩杀国师，澄清宇内。
李云崖要跟这些人抢夺话语权，他把大明侯报开到江南各省，阐述新学，给教育部播了一百万两银子的经费，让身为教育部长的徐骥，也就是徐光启的儿子在各地建公立学校，县里必有小学，州府必有中学，省里必有大学，并指定教学大纲，编纂各科教材，刊印发布，并规定，凡能入学者，一律不收任何费用，老师的束脩，教科书等费用，全部由国家来出，学生只要自带纸笔、饮食即可，还规定，以后考入新的体制必须最少要有小学的学历，原来科举制学四书五经考出来的秀才、举人，新体制概不承认！
士大夫阶层对此自然更是不满，愤恨无比，一再贬低新学，说这些只是奇技淫巧，旁门左道，不是圣人之学。绝大多数人家，凡是条件好的，仍然读四书五经。
但家境贫寒的大有人在，仍有不少把孩子送到学校里来接受新学教育。
这年头读书可不是个容易的事，整个村子也找不到一本书的地方十分普遍，能够识文断字，会个百以内加减法的就算很有学问了，新学校里只要带上派出所颁发的户口本就可以去上学，白拿刊印好的教材，这种好事，对于官绅阶层来说不值得一提，对于穷苦人家可是天上掉馅饼的大喜事，不冲别的，能让孩子多认识几个字，以后能送到城里当伙计，总比在农村跟全家人死守几亩地强！
因此，全国的小学校开始如火如荼地办起来，招生情况比李云崖预想的要好的多。
士族阶层用很鄙视地态度，把新学定为“贱学”，只有卑贱的泥腿子才学的东西，跟他们自己的孔孟之道，圣人之学根本无法相提并论。
舆论阵地不能失守，李云崖在大明侯报上接连数期发表文章，指出现在孔孟之道，是汉朝董仲舒罢黜百家独尊儒术之后才成为主流学问，而在那之前，汉朝都是才用黄老之学，孔子和孟子是圣人，老子更是圣人中的圣人，新学兼容道、儒、墨等百家之长，亦是圣人之学。
他这个说法自然被广大士大夫阶层嗤之以鼻，但也还是有不少读书人听进去了，专门弄来一套小学教材进行研究。
同时，李云崖开始推广“文言一致”，即日常怎样说话，文章里就怎样写，不必追求起承转合，不必追求四六骈体，更不用掉书袋，并提倡使用简体字，中国文字经过数千年衍化，经历过篆书、楷书等数次大的变化，李云崖让教育部将一大批太过繁琐，二十笔画以上的字做了简化修改，以便于推广，达成教育普及。
他在报纸上明确地写出，自己身为国师，在教四岁的太子朱慈烺小朋友时候，用的就是新学，就是简体字，将来教自己的干儿子，朱慈烜小朋友的时候，同样用这一套。
文人们拿着报纸看到这条新闻，无不大声痛骂妖道不止要灭亡大明江山，更要连整个民族千年文化传承一举灭绝，纷纷作诗做文章，要生啖妖道之肉，渴饮妖道之血，恨不能立即率领百万雄兵，上京将妖道抓住，挫骨扬灰，不到一年时间，各种描写妖道的小说画本遍布江南，把李云崖描述成一个会魅惑之术，又有断袖之癖，勾引住皇上朱由检，每天要吃九百九十九个小孩心肝炼药的盖世妖道，并说善恶到头终有报，妖道数年之内必遭天谴！
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